Su historia documental arranca tempranamente, con menciones
desde el siglo IX al Valle de Cayón. Sus tierras fueron
señorío de los Garcilaso y del Marqués
de Santillana, aunque este régimen suscitó grandes
resistencias que dieron lugar a los pleitos Viejo y de los
Valles, que se saldarían con la vuelta al realengo.
Fue uno de los municipios que tomó parte en las Juntas
de Puente San Miguel, donde se constituyó en el siglo
XVIII la provincia de Cantabria.
Santa María de Cayón es un territorio rico
en lo que a monumentos se refiere. Las iglesias parroquiales
de la capital municipal (siglo XII), San Andrés (de
la misma época), en Argomilla y dotada con sarcófagos
de una necrópolis romana, y la ermita de San Miguel
de Cerdeña, también románica (siglo XIII),
son sus valores más apreciados.
Merece también mención el conjunto urbano de
Esles, con numerosos caseríos y un cementerio altomedieval
alrededor de la ermita de San Vicente, donde en el siglo IX
fue fundado el monasterio de San Vicente de Fístoles.
Conserva numerosas tumbas, incluso en el interior de la ermita.
